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文檔簡介
1、 1. 安裝軟件Primer premier5.0。程序下載:Primer Premier 5.0 2. 安裝好以后就會在程序中雙擊打開。開始設計克隆目的基因的引物。兩分鐘StepByStep學會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0 打開后的界面如圖。點FILE-NEWDNA SEQUENCE如圖所示。2 3選中primer圖標,點S圖標,edit primer,開始設計正義鏈。2006-3-21 09:48:26 上傳下載附件 (41.94 KB) 兩分鐘StepByStep學會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0 軟件默認引物為二五個堿基 2006-3-21 09:49
2、:25 上傳下載附件 (40.99 KB) 兩分鐘StepByStep學會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0 可將鼠標點在設計框的3端從右向左刪除79個堿基,保留1618個配對即可 2006-3-21 09:50:11 上傳下載附件 (38.98 KB) 兩分鐘StepByStep學會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0 在引物的5端加入選好的酶切位點并在其左側加3個保護堿基,入該圖加入HIND III酶切位點及TTA保護堿基,完成后點analyze,認為可以后點OK。 2006-3-21 09:51:11 上傳下載附件 (40.15 KB) 兩分鐘StepByStep學
3、會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0 選中左上角A圖標,用鼠標拉動滑塊將待選引物放至目的基因末端。如圖,選中EDIT PRIMERS圖標,開始設計反義鏈。2006-3-21 09:51:51 上傳下載附件 (41.22 KB) 兩分鐘StepByStep學會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0 使用道具 舉報 顯身卡 yiii yiii 當前離線 注冊時間2004-9-12積分30794最后登錄2012-4-5在線時間1429 小時秀蛋白1488 個秀基因20889 個精華31主題19記錄9好友257日志3相冊0帖子2419UID3IP卡 狗仔卡 Administrato
4、r秀蛋白1488 個秀基因20889 個積分30794帖子2419串個門 加好友 打招呼 發消息 4-樓 發表于 2006-3-21 09:56:34 |只看該作者 從3端刪除79個堿基同正義鏈。2006-3-21 09:54:12 上傳下載附件 (36.92 KB) 兩分鐘StepByStep學會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0 將酶切位點加在5端,應將產品目錄所示的酶切位點序列從右至左加入(注意不要加反)如圖加入BamH I酶切位點及CGC3個保護堿基。完成后點analyze,認為可以后點OK。2006-3-21 09:54:47 上傳下載附件 (38.89 KB) 兩分鐘S
5、tepByStep學會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0 最后分析結果如圖,反義鏈的FALSE PRIMING可以不考慮,RATING表示引物評分也可以不考慮,主要看Tm值正義鏈和反義鏈相差不應超過3度。GC含量不應超過602006-3-21 09:55:27 上傳下載附件 (41.17 KB) 兩分鐘StepByStep學會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0 該軟件有個缺點,不能保存分析結果,只能選擇打印 2006-3-21 09:55:53 上傳下載附件 (42.2 KB) 兩分鐘StepByStep學會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0 如果設計RT-
6、PCR檢測的引物就如下所示。同上輸入目的基因片段,選SEARCH圖標,選擇參數,一般選PCR primers-both100至250個堿基,引物長短20/-2,search parametere中的參數可以不選,為默認設置。點OK。 2006-3-21 09:56:26 上傳下載附件 (39.56 KB) 兩分鐘StepByStep學會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0 6i6CQvCp.jpg (41.22 KB, 下載次數: 89) 2006-3-21 09:53:47 上傳下載次數: 89兩分鐘StepByStep學會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0使用道具 舉
7、報 顯身卡 yiii yiii 當前離線 注冊時間2004-9-12積分30794最后登錄2012-4-5在線時間1429 小時秀蛋白1488 個秀基因20889 個精華31主題19記錄9好友257日志3相冊0帖子2419UID3IP卡 狗仔卡 Administrator秀蛋白1488 個秀基因20889 個積分30794帖子2419串個門 加好友 打招呼 發消息 5-樓 發表于 2006-3-21 10:00:14 |只看該作者 顯示滿足設計參數的候選結果,點OK.2006-3-21 09:58:42 上傳下載附件 (41.16 KB) 兩分鐘StepByStep學會引物設計軟件PRIMER PREMIER5.0 點SENES選擇正義鏈,RATING表示引物評分,最好選評分高的。2006-3-
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